Що таке крива розрідження в мікробіомі?

0 Comments 22:26

Ця крива є графік залежності кількості видів від кількості зразків. Криві розрідження зазвичай швидко ростуть спочатку, оскільки найпоширеніші види знайдені, але криві стають плато, оскільки лише найрідкісніші види залишаються для відбору.

Криві розрідження оцінити очікувану кількість видів для заданого розміру вибірки (що має бути рівним або меншим за фактичну вибірку) на основі моделі гіпергеометричного розподілу (Hurlbert, 1971; Sanders, 1968).

Основною метою кривої розрідження, яка є графічним результатом аналізу розрідження, є оцінити повноту зразка та дослідити біорізноманіття. Спостерігаючи за формою кривої, ми можемо зробити висновок, чи була більшість видів спостережена в межах певної кількості зразків.

Мікробні екологи використовували його для порівняння даних про послідовність генів 16S рРНК за останні 25 років (6–8). З розрідженням, дослідник обирає бажаний поріг секвенування та видаляє будь-які зразки нижче цього порогу. Потім вони випадковим чином вибирають таку кількість послідовностей без заміни з кожного зразка.

Для аналізу метагеномних даних використовуються методи біоінформатики. Крива розрідження (рис. 2) може бути використовується для визначення того, чи зразок секвеновано до ступеня, достатнього для представлення його справжньої різноманітності.

Ця крива є графік залежності кількості видів від кількості зразків. Криві розрідження зазвичай швидко ростуть спочатку, оскільки найпоширеніші види знайдені, але криві стають плато, оскільки лише найрідкісніші види залишаються для відбору.

Related Post

Як довго Фріза тренувалася для Resurrection F?Як довго Фріза тренувалася для Resurrection F?

Дізнавшись, що Гоку переміг Маджіна Буу та бився з Бірусом до глухого кута, обоє були тими двома фігурами, яких його батько застерігав ніколи не перетинати, Фріза вирішує піддатися чотири місяці

Чи можу я використовувати передавач USB Bluetooth на своєму телевізорі?Чи можу я використовувати передавач USB Bluetooth на своєму телевізорі?

Що робити, якщо мій телевізор не підтримує Bluetooth? Якщо ваш телевізор не підтримує Bluetooth, але ви все одно хочете підключити динамік або навушники Bluetooth, ви можете отримати адаптер Bluetooth. Їх