Світло-блакитна рамка: рівень експресії низький (від 0,5 до 10 FPKM або 0,5-10 TPM) Середня блакитна рамка: рівень експресії середній (від 11 до 1000 FPKM або 11-1000 TPM) Темно-синя рамка: рівень експресії високий (більше 1000 FPKM або більше 1000 TPM)
Для певного зразка РНК, якби ви секвенували один мільйон повнорозмірних транскриптів, значення TPM представляє кількість транскриптів, які ви б побачили для даного гена чи ізоформи. Середній TPM дорівнює 106 (1 мільйон), поділений на кількість анотованих стенограм у даній анотації, і, таким чином, є константою.
Колін Дьюї Ось як я люблю це пояснювати: TPM (транскрипції на мільйон) – це технологічно незалежний показник чисельності (це лише частка, як PPM (частки на мільйон)). RNA-Seq — це одна з багатьох технологій, яку можна використовувати для оцінки чисельності (у TPM) для кожного гена або транскрипту.
TPM (транскрипти на мільйон кілобаз) Підрахунок на довжину стенограми (кб) на мільйон читань, зіставлених на карті. при порівнянні експресії різних генів у зразку.
Впровадження програми TPM створює спільну відповідальність за обладнання, що заохочує більшу залученість працівників підприємства. У правильному середовищі це може бути дуже ефективним підвищення продуктивності (збільшення часу роботи, скорочення часу циклу та усунення дефектів).
Сіра рамка: рівень експресії нижчий від межі (0,5 FPKM або 0,5 TPM) Світло-блакитна рамка: рівень експресії низький (від 0,5 до 10 FPKM або 0,5 до 10 TPM) Середня синя рамка: рівень експресії середній (від 11 до 1000 FPKM або від 11 до 1000 TPM) Темно-синя рамка: рівень експресії високий (більше 1000 FPKM або більше 1000 TPM)